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利用該方法從海洋沉淀物中純化了厭氧共生的甲烷氧化菌株,隨后
利用代謝基因組測(cè)序,PCR,顯微法觀察,發(fā)現(xiàn)這些捕捉的細(xì)菌沒(méi)有預(yù)
期的多樣性,但有新的功能性和與共生菌相關(guān)的代謝。磁電機(jī)一FISH方
法唯一的優(yōu)勢(shì)是它能夠修復(fù)包含整個(gè)未培養(yǎng)目標(biāo)生物的基因組。附加說(shuō)
明是非目標(biāo)微生物可能伴隨著富集體被純化出來(lái)。雖然單獨(dú)的物理公式
不足以證明共生關(guān)系,但靠磁電機(jī)一FISH和代謝基因的鑒定推斷可能的
共生關(guān)系是接下來(lái)探索的新領(lǐng)域
細(xì)胞代謝技術(shù)
到目前為止,我們已經(jīng)討論了應(yīng)用熒光探針來(lái)鑒定生物多態(tài)性的單
細(xì)胞技術(shù),并提供了同位素標(biāo)記或基因組分析來(lái)推斷功能的方法。大多
數(shù)熒光探針的應(yīng)用能夠被用于確定包括pH、膜通透性、酶活力、反應(yīng)氧
氣和氮組分、毒性和生存能力等的參數(shù)。分子探針生產(chǎn)商擅長(zhǎng)生產(chǎn)熒光
反應(yīng)物來(lái)檢測(cè)活細(xì)胞的各種活動(dòng)。
現(xiàn)今發(fā)展的另外一項(xiàng)技術(shù)為磁電機(jī)一FISH。磁電機(jī)一FISH將16SrRN
A靶向的FISH技術(shù)和一種即酪氨信號(hào)放大的擴(kuò)增技術(shù)相結(jié)合(CARD—FISH
)(Pernthaler等,2002),利用帶抗體的免疫熒光磁珠捕捉雜交細(xì)胞后
應(yīng)用于CARD—FISH流程。從復(fù)雜環(huán)境樣本中選擇性捕捉靶生物,結(jié)合基
因組和代謝基因的PCR分析可以提供有關(guān)直接從環(huán)境中發(fā)現(xiàn)的未培養(yǎng)微
生物潛在的代謝信息。
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