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本文標題:"地質(zhì)微生物的代謝率可能非常慢-微生物研究顯微鏡"

新聞來源:未知 發(fā)布時間:2018-5-3 16:39:32 本站主頁地址:http://m.mhzljd.cn

地質(zhì)微生物的代謝率可能非常慢-微生物研究顯微鏡

  由于微生物全基因組的序列分析現(xiàn)在已經(jīng)很常見,這樣以全基因組
序列來考慮系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系也是可能的。

  根據(jù)特異的16S rRNA核苷酸序列設(shè)計出的探針可以被直接應(yīng)用于完
整細胞的檢測,探針能夠滲透到經(jīng)過處理的細胞表面內(nèi)與相應(yīng)的核糖體
16S rRNA核苷酸序列雜交。當這些探針被熒光或放射性同位素標記時,
與探針發(fā)生反應(yīng)的細胞能夠直接分別被熒光或放射自顯影觀測到。這種
熒光顯微技術(shù)稱為熒光原位雜交技術(shù)(VlSn)。16S rRNA探針可以是針對
屬,也可以針對種,還可以針對特定的菌株設(shè)計。這種方法的前提是基
因可以被激活轉(zhuǎn)錄(一些重要地質(zhì)微生物的代謝率可能非常慢以至于存
在的rRNA不足以被檢出),它只適用于已知序列,并且存在著相關(guān)但非
靶向的基因干擾鑒定等問題。這些問題的第一個解決方法是催化報道子
放大信號技術(shù);這種技術(shù)已被用于環(huán)境土壤和金屬膜表面的生物鑒定。
另一種技術(shù)——染色體繪制技術(shù),可以利用熒光標記的核苷酸探針,用
于直接靶定基因組DNA,而不需要在基因表達的情況下鑒定特異序列。
  除了生物探針用于鑒定已知序列,各種不依賴培養(yǎng)的分子生物方法
可以用來檢測環(huán)境中的(新)物種,并評估微生物的多樣性。依靠聚合酶
鏈式反應(yīng)技術(shù)(PCR)以靶向16S rRNA(16S rDNA)基因為模板,能夠在DNA
提取物中擴增到16S rRNA基因。擴增出混合的16S rDNA必須被解析。一
種方法是應(yīng)用克隆方法。每個克隆的16S rDNA用PCR再次擴增并確定rRN
A核苷酸序列。這有時會涉及建克隆文庫。

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